MEDITE is a text alignment software designed by Jean-Gabriel Ganascia that automatically identifies four types of transformations between two linear states of a text: deletions, insertions, replacements and displacements. The particularity of MEDITE is to be able to reliably identify displacements, which does not exist in any other alignment software.
To view the alignment results, the two texts are presented side by side on a graphical interface that highlights, using different colors, the inserted, deleted, replaced and moved blocks. The aligned blocks are linked together by a simple mouse click to facilitate the visualization and analysis of the results.
The MEDITE algorithm is based in particular on the suffix-tree method to detect homologous sequences between the two text states as well as on a method for optimizing the order of these sequences based on Hidden Markov models (HMM).
MEDITE is particularly useful for textual genetics work and the preparation of critical editions involving the annotation of variants.
MEDITE is currently being updated. The new version of the software will have a new interface and will allow to compare texts transcribed in XML-TEI. It will be delivered in a web version, freely accessible, and in a batch version, executable by command line, in order to facilitate its integration in digital environments.
Bourdaillet J., Ganascia J.-G., Lebrave J-L., “Topologie et génétique textuelles : un dialogue médié par la machine”, Lexicometrica, numéro thématique “Topographie et topologie textuelles”, 2009, ISSN 1773-0570 [pdf]
Fenoglio I., Ganascia J-G. : « MEDITE : un logiciel pour l'approche comparative de documents de genèse », Revue Genesis, pp. 166-168, 2007
Bourdaillet J., Ganascia J-G, “Practical block sequence alignment with moves”, LATA 2007, International Conference on Language and Automata Theory and Applications, mars-avril 2007.
Bourdaillet J., Ganascia J.-G., “Alignement of Noisy Unstructured Text Data”, IJCAI-2007 Workshop on Analytics for Noisy Unstructured Text Data, Hyderabad, India - January 8, 2007.
MEDITE est un logiciel d'alignement de texte conçu par Jean-Gabriel Ganascia qui permet d’identifier automatiquement les transformations entre deux états linéaires d’un texte, ces transformations étant de quatre types : suppressions, insertions, remplacements et déplacements. La particularité de MEDITE est de parvenir à identifier de façon fiable les déplacements, ce qui n’existe dans aucun autre logiciel d’alignement.
Pour visualiser les résultats de l'alignement, les deux textes sont présentés côte à côte sur une interface graphique qui met en évidence, à l'aide de couleurs différentes, les blocs insérés, supprimés, remplacés et déplacés. Les blocs alignés sont reliés entre eux par un simple clic de souris afin de faciliter la visualisation et l’analyse des résultats.
L’algorithme de MEDITE repose notamment sur la méthode des arbres de suffixes pour détecter des séquences homologues entre les deux états du texte ainsi que sur une méthode d’optimisation de l’ordre de ces séquences basée sur les modèles de Markov cachés (HMM).
MEDITE est notamment très utile pour les travaux de génétique textuelle et la préparation d'éditions critiques impliquant l'annotation de variantes.
MEDITE est actuellement en cours de mis à jour. La nouvelle version du logiciel sera dotée d’une nouvelle interface et permettra de comparer les textes transcrits en XML-TEI. Elle sera livrée dans une version web, librement accessible, et dans une version batch, exécutable par ligne de commande, afin de faciliter son intégration dans des environnements numériques.
Bourdaillet J., Ganascia J.-G., Lebrave J-L., “Topologie et génétique textuelles : un dialogue médié par la machine”, Lexicometrica, numéro thématique “Topographie et topologie textuelles”, 2009, ISSN 1773-0570 [pdf]
Fenoglio I., Ganascia J-G. : « MEDITE : un logiciel pour l'approche comparative de documents de genèse », Revue Genesis, pp. 166-168, 2007
Bourdaillet J., Ganascia J-G, “Practical block sequence alignment with moves”, LATA 2007, International Conference on Language and Automata Theory and Applications, mars-avril 2007.
Bourdaillet J., Ganascia J.-G., “Alignement of Noisy Unstructured Text Data”, IJCAI-2007 Workshop on Analytics for Noisy Unstructured Text Data, Hyderabad, India - January 8, 2007.
Le principal objectif de cet axe de recherche est de parvenir à articuler deux approches de recherches complémentaires sur les données des corpus de textes et d'images : l'analyse locale et la description fine de ces corpus (dans le cadre d'éditions critiques par exemple) et le recours à des outils numériques de recherche plus orientés sur l'analyse quantitative et le développement de méthodes d'apprentissage applicables à de plus grands ensembles de corpus.
Dans cette perspective, l’équipe travaille sur :
Nous travaillons aussi, dans le cadre des projets ENCCRE et 3D-SYSCREETIC, à étendre ces objectifs aux corpus iconographiques, sujet pour l’instant peu abordé dans le domaine des humanités numériques, mais pour lequel des techniques informatiques laissent espérer le développement d’outils adaptés aux besoins des équipes de sciences humaines travaillant sur ce type de données.
Cet axe est coordonné par Jean-Gabriel Ganascia, Alexandre Guilbaud et Glenn Roe.
The main objective of this second research axis is to articulate two complementary research approaches on data from text and image corpora: local analysis and detailed description of these corpuses (such as critical editions) and the use of digital research tools more oriented towards quantitative analysis and the development of learning methods applicable to larger corpus sets. With this perspective, our team is working on:
We are also working, in the framework of the ENCCRE and 3D-SYSCREETIC projects, to extend these objectives to iconographic corpora, a subject that has not yet been addressed very much in the field of digital humanities, but for which computer techniques give hope for the development of tools adapted to the needs of humanities teams working on this type of data.
This axis is coordinated by Jean-Gabriel Ganascia, Alexandre Guilbaud and Glenn Roe.
CODIGITARCH is a collaborative web application with a digital interface enabling to test, annotate and share hypotheses of archaeological restitution or reconstitution on corpuses of 3D digitized lapidary fragments.
This application, currently under development, has been designed on the basis of the experience gained and the methodological reflection carried out with the test corpus of the NumeRO project. It integrates:
CODIGITARCH est une application web collaborative dotée d’une interface numérique permettant de tester, d’annoter et de partager des hypothèses de restitution ou reconstitution archéologiques sur des corpus de fragments lapidaires numérisés en 3D.
Cette application, en cours de développement, a été conçue à partir de l’expérience accumulée et de la réflexion méthodologique menée à partir du corpus test du projet NuméRO. Elle intègre :
The antique theatre of the Roman colony of Arausio (the current city of Orange, in the Vaucluse District, France) is one of the best preserved in the Roman world: its unique feature is that it has preserved both its stage wall and an important part of its marble ornament. However, it is paradoxically difficult to propose a complete restitution, due to the conservation conditions, the presence of old restorations and the extreme fragmentation of the remains. The NumeRO project, which is part of a revival of theatre research and a long-term architectural study, aimed to apply three-dimensional modelling techniques to this fragmented lapidary corpus in an attempt to overcome some of these obstacles. Based on the collaboration of three research teams (ISCD, EA 4081 and IRAA CNRS), it was supported by the Convergence ‘‘Science et Patrimoine culture’’ programme of Sorbonne Universities in 2015 and gathered expertise in archaeology, architecture, art history, mathematics and computer sciences to restore its figurative set from the digital facsimiles of some of the preserved fragments, now separated from their original monument.
The project focused more specifically on one of the four continuous friezes documented in the theatre, which represents a Dionysian procession. This frieze has remained practically unpublished because of its iconographic complexity, which makes its interpretation and restitution particularly problematic. Indeed, traditional two-dimensional surveying methods lead to a dead end, because it was not enough to propose a plausible sequence of figures, but it was necessary to really consider the three-dimensional aspect of the fragments, their thickness, their fixing mortises, the location and depth of the reliefs, the tool marks, all data that can be understood simultaneously by using 3D digital imaging techniques. The preserved fragments (about a hundred) were therefore digitized in 3D by digital photogrammetry. The resulting facsimiles were scaled so that they could be viewed, manipulated and associated in the same workspace.
The purpose of this acquisition was to formulate proposals for the restitution of the Dionysian frieze. Despite the very poor state of conservation of this frieze, the approach is scientifically justified by the implementation of a vocabulary and iconographic syntax characteristic of the so-called ‘‘neo-attic’’ current, based on complex combinatorials of repertory figures certified on numerous marble artifacts relaying from this current, which makes it possible to virtually reproduce many of the missing sections.
The restored frieze has been added to the three-dimensional model of the monument used in the SONAT project. In addition, many other decorative fragments have since been digitized, including the Centaurs frieze, which is currently being reconstituted but also being “virtually restored’’.
Finally, the NumeRO project is at the origin of the CODIGITARCH project, which consists in the development of an online digital environment specifically designed for the archaeological study of groups of lapidary fragments.
Le théâtre antique de la colonie romaine d’Arausio (l’actuelle ville d’Orange, dans le Vaucluse) est l’un des mieux préservés du monde romain ; il a pour particularité unique d’avoir conservé à la fois son mur de scène et une part importante de sa parure de marbre. Or il est paradoxalement difficile d’en proposer une restitution complète, du fait des conditions de conservation, de la présence de restaurations anciennes et de l’état de fragmentation extrême des vestiges. Le projet NuméRO, qui s’inscrit dans le cadre d’une reprise des recherches sur le théâtre et d’une étude architecturale de longue haleine, visait à appliquer les techniques de modélisation en trois dimensions à ce corpus lapidaire fragmenté pour tenter de dépasser une partie de ces obstacles ; fondé sur la collaboration de trois équipes de recherche (ISCD, EA 4081 et IRAA CNRS), il a bénéficié du soutien du programme Convergence « Science et Patrimoine culturel » de Sorbonne Universités en 2015 et a mobilisé des compétences en archéologie, architecture, histoire de l’art, mathématiques et sciences de l’information pour restituer son décor figuré à partir des fac-similés numériques d’une partie des fragments conservés, aujourd’hui dissociés de leur monument d’origine.
Le projet a porté plus spécifiquement sur l’une des quatre frises continues attestées au théâtre, qui représente un cortège dionysiaque. Cette frise est demeurée pratiquement inédite en raison de sa complexité iconographique, qui rend son interprétation et sa restitution particulièrement problématiques. En effet les méthodes traditionnelles de relevé en deux dimensions mènent à une impasse, car il ne suffit pas de proposer une séquence plausible de figures, mais il convient de prendre en compte réellement l’aspect tridimensionnel des fragments, leur épaisseur, leurs mortaises de fixations, l’implantation et la profondeur des reliefs, les traces d’outils, toutes données que le recours aux techniques d’imagerie numérique 3D permet d’appréhender simultanément. Les fragments conservés (une centaine environ) ont donc fait l’objet d’une numérisation 3D par photogrammétrie numérique. Les fac-similés ainsi obtenus ont été mis à l’échelle de manière à pouvoir être visualisés, manipulés et associés dans un même espace de travail.
Cette acquisition avait pour objectif de formuler des propositions de restitution de la frise dionysiaque. Malgré l’état de conservation très lacunaire de cette dernière, la démarche est scientifiquement justifiée par la mise en œuvre d’un vocabulaire et d’une syntaxe iconographiques caractéristiques du courant dit « néo-attique », fondés sur des combinatoires complexes de figures de répertoire attestées sur de nombreux artefacts en marbre relevant de ce courant, ce qui rend possible la restitution virtuelle d’une grande partie des sections manquantes.
La frise restituée est venue enrichir la maquette tridimensionnelle du monument utilisée dans le cadre du projet SONAT. En outre de nombreux autres fragments de décor ont pu être numérisés depuis lors, notamment la frise des Centaures, qui fait actuellement l’objet d’une restitution mais aussi d’une « restauration virtuelle ».
Enfin le projet NuméRO est à l’origine du projet CODIGITARCH, qui consiste en la mise au point d’un environnement numérique en ligne spécifiquement conçu pour l’étude archéologique de groupes de fragments lapidaires.
Le projet SONAT est né du constat selon lequel les restitutions archéologiques en 3D, qui sont régulièrement proposées pour « faire revivre » les monuments du passé, ne prennent que très rarement en compte, précisément, la réalité quotidienne, les fonctions et les usages de ces derniers ; c’est particulièrement le cas des monuments de spectacle, qui n’apparaissent souvent que comme de somptueux écrins architecturaux. Quoique notre information sur les performances théâtrales antiques soit très lacunaire, le projet SONAT entend tirer parti des travaux approfondis menés par une partie de l’équipe sur l’architecture théâtrale romaine pour proposer la reconstitution partielle du « paysage sonore » d’un des théâtres les mieux conservés du monde romain, celui d’Orange (antique Arausio). Il s’appuie sur une double modélisation : celle de l’architecture d’une part, avec l’élaboration d’une maquette numérique du théâtre reflétant l’état actuel des connaissances et intégrant également des composantes architecturales aujourd’hui disparues (toiture, velum, rideau de scène), celle du son d’autre part, rendue possible par le développement de nouvelles technologies de simulation numérique.
Ce projet pluridisciplinaire réunit des spécialistes de théâtre et d’architecture antiques, d’acoustique, d’histoire ancienne, de musique et de modélisation 3D appartenant à cinq équipes ou institutions : l’équipe « Rome et ses renaissances » de Sorbonne Université, l’Université de Poitiers, l’IRAA du CNRS, le CMAP et le Musée d’Orange.
L’exploration de la réalité sonore du monument se fonde tout d’abord sur une analyse précise des sources relatives aux spectacles théâtraux d’époque impériale ; elle comporte également une étude des propriétés acoustiques du monument, et comprend enfin un volet expérimental de simulation sonore, rendu possible à la fois par le développement par R. Gueguen d’un outil de mesure spécifique qui prend en compte la configuration architecturale du monument et ses matériaux, ainsi que la position précise des sources sonores et des auditeurs, et par une collaboration avec S. Hagel (Académie des Sciences de Vienne), philologue, musicologue et musicien, qui a procédé à des enregistrements en chambre anéchoïque à partir de fac-similés d’instruments antiques.
Le projet doit aboutir dans le courant de l’année 2019 à la production d’un film d'animation 3D de restitution visuelle et sonore du théâtre antique d'Orange, proposant une série de séquences ou « tableaux » musicaux et scéniques, mais aussi d’ambiance, illustrant les préparatifs d’un spectacle au début de l’empire. Ce travail de reconstitution implique la finalisation de l’auralisation – ou implémentation – des sons reconstitués dans la maquette numérique du théâtre d’Orange. Il constituera un état des lieux, présenté au format numérique, des dernières connaissances et hypothèses autour du monument et de ses propriétés acoustiques.
SONAT is born from the observation that 3D archaeological reconstructions, which are regularly proposed to ‘‘bring back to life’’ monuments of the past, only very rarely take into account, precisely, the daily reality, functions and uses of these monuments. This is particularly the case for theatres, which often appear only as sumptuous architectural sceneries. Although our information on antique theatrical performances is very incomplete, the SONAT project intends to take advantage of the in-depth work carried out by a part of the team on Roman theatrical architecture to propose a partial reconstruction of the ‘‘sound landscape’’ of one of the best preserved theatres in the Roman world, Orange (antique Arausio). It is based on a double modeling: on the one hand the architectural modeling with the elaboration of a digital model of the theatre reflecting the current state of knowledge and also integrating architectural components that have now disappeared (roof, velum, stage curtain), and on the other hand, the acoustic modeling, made possible by the development of new digital simulation technologies.
This multidisciplinary project brings together specialists in ancient theatre and architecture, acoustics, ancient history, music and 3D modelling from five teams or institutions: the ‘‘Rome et ses renaissances’’ team of Sorbonne University, the University of Poitiers, the IRAA of the CNRS, the CMAP and the Orange Museum.
The exploration of the sound reality of the monument is based, first, on a precise analysis of the sources relating to imperial period theatrical performances. It also includes a study of the acoustic properties of the monument, and an experimental sound simulation component, made possible both by the development by R. Gueguen of a specific measuring tool that takes into account the architectural configuration of the monument and its materials, as well as the precise position of sound sources and listeners, and through a collaboration with S. Hagel (Vienna Academy of Sciences), philologist, musicologist and musician, who made anechoic chamber recordings from facsimiles of ancient instruments.
The project is expected to result in a 3D animated film in 2019 that will provide a visual and sound restitution of the antique theatre of Orange, offering a series of musical and scenic sequences or ‘‘paintings’’, but also an atmosphere, illustrating the preparations for a show at the beginning of the empire. This reconstruction work involves finalizing the auralization – or implementation – of the reconstituted sounds in the digital model of the Orange theatre. It will constitute an inventory, presented in digital format, of the latest knowledge and hypotheses around the monument and its acoustic properties.
SONAT is born from the observation that 3D archaeological reconstructions, which are regularly proposed to ‘‘bring back to life’’ monuments of the past, only very rarely take into account, precisely, the daily reality, functions and uses of these monuments. This is particularly the case for theatres, which often appear only as sumptuous architectural sceneries. Although our information on antique theatrical performances is very incomplete, the SONAT project intends to take advantage of the in-depth work carried out by a part of the team on Roman theatrical architecture to propose a partial reconstruction of the ‘‘sound landscape’’ of one of the best preserved theatres in the Roman world, Orange (antique Arausio). It is based on a double modeling: on the one hand the architectural modeling with the elaboration of a digital model of the theatre reflecting the current state of knowledge and also integrating architectural components that have now disappeared (roof, velum, stage curtain), and on the other hand, the acoustic modeling, made possible by the development of new digital simulation technologies.
